在文革，愛國會的神父主教受盡凌辱痛苦，他們所受的痛苦，比其他人更大，其中原因是，不單單政府壓迫他們，其他同輩，不屬愛國會的人，也不體諒他們，甚至連教友也不，這便形成愛國會的神父主教在獨自面對一切的壓迫。

另一方面，早期不肯加入愛國會的主教及神父，例如龔品梅主教、鄧以明總主教等人，早早便被收監了。但這情況，意想不到的是，竟是因禍得福，因為，在監獄中，原來才是逃避文革衝擊的最好地方。

文革時期，甚至連共產黨員自己也受到批鬥，例如高官如鄧小平，其子也在文革中被人打至傷殘，鄧小平自己也三上三落。連這樣的高官也不能自保，何況天主教神父？所以，愛國會神父主教們也失去了保護他們的人。

但是，一早在監獄中的神父主教們，卻是在最安全的地方，雖然是失去了自由，但卻是不受身體和精神傷害，是文化大革命中的人間淨土，因為，紅衛兵們，無論如何，也不會想到入監批鬥別人，他們要批鬥的，是在社會上有地位的人，打倒一切現存制度。

而在獄中的神長們，就認為這是一個修煉的好時機。鄧以明總主教在《天意莫測》中寫道：「我的坐牢，是我初學的延長。」

林瑞琪博士認為，聖神往往另有計劃，祂竟然藉著共產黨所建的監獄，為教會的生存，保留了一份再生的力量，在文革退卻後，神長們能為教會獻出他們生命的餘暉。(明)