天主教下一波遭受的迫害，是「禮儀之爭」。結果是換來康熙帝的禁教，但是，這一波的禁教，不能完全怪責康熙帝，教廷也要負上責任。

首先是道明會黎玉範神父反對耶穌會士沿用利瑪竇規矩，准許中國人祭祖，上書教廷，教廷在1645年回覆，不准祭祖。

耶穌會派衛匡國神父回羅馬說明真相，教廷在1656年准許祭祖等習俗。

1704年，教宗克萊孟十一世發出禁止祭祖禁令，並在1715年，發出《從登極之日》(Ex Illa Die)通諭，不准使用「上帝」和「天」這些字眼、不准祭祖祭孔、不准入孔子廟行禮、不准在家設靈位。

康熙帝大怒，驅逐教廷傳話使節，下令只有遵「利瑪竇規矩」之人，才可繼續傳教。康熙帝在1720年回覆：「既然如此，天主教在中國行不通，務必禁止。教既不行，在中國傳教之西洋人亦屬無用，除會技藝之人留用外，其餘在中國傳教之人，爾俱帶回西洋去！」

1742年，教宗本篤十四世頒布《自上主聖意》(Ex Quo Singulari)，再次申令不准祭祖。

康熙帝的禁教令，要到1846年，列強侵略，由道光帝取消，但傳教士卻是連同槍炮一起進入中國，惹人反感。

而教廷不准中國人祭祖之禁令，要到1939年，由庇護十二世取消。

以上的說明，當然是省略了很多細節，亦不能說教廷或中國朝廷全錯，雙方有不少誤會，而當時通訊又不發達，總之，結果就是這樣，悲劇！(明)